Значительной составляющей Дома дружбы народов на ВВЦ (ВДНХ) был Музей дружбы народов, в фондах которого хранилось более 10 тысяч экспонатов, отражающих историю, культуру и быт народов России.
В Доме народов России работал Музей дружбы народов, созданный в 1996 году в соответствии с Концепцией Государственной национальной политики Российской Федерации. Он знакомил посетителей музея с уникальной практикой межэтнических отношений в нашей стране, с историей и культурой многочисленных народов России и стран СНГ. Инициатором создания был член Союза журналистов России Юрий Сергеевич Дербенёв. 22 года - с основания Музея по сей день - он является директором Музея.
В мае 2015 года часть экспозиции Музея размещена в Культурно-этнографическом комплексе «Моя Россия» в Красной Поляне города Сочи.